战争前夕朝鲜战船数量总共只有250余艘，当时庆尚、全罗两道水军阵容有庆尚左水使朴弘、庆尚右水使元均、全罗左水使有李舜臣、全罗右水使李亿祺。战争爆发以后庆尚道的水军还未正式交锋便溃散，朝鲜水军实际上由全罗左、右水使水军掌控，由李舜臣负责指挥。
李舜臣第一次出兵时虽然元均也有加入，但也可以说是李舜臣一人独挡的。1592年5月4日到8日的战争，李舜臣在玉浦、合浦、赤珍浦海战中击毁日本战船37艘大获全胜，我军只有一人轻伤。
第二次出兵是在5月29日到6月10日，在洒川、唐浦、唐项浦、栗浦等四次海战中，击破了敌船72艘、斩获敌兵88人，而此时朝鲜军损失只有11人战死、26人受伤。在二次出战中有全罗右水使李亿祺的舰队会合，加上元均的3艘船只，联合舰队的规模达到了51艘，特别是从洒川海战开始利用的龟甲船，战斗中其强大的作用得到了验证。
第三次出兵是在第二次战斗约一个月以后的7月6日到13日之间。6日李舜臣会同李亿祺指挥90余艘舰队离开全罗左水营，在南海露梁与庆尚右水使元均会合。并引诱停泊在见乃梁的日本舰队到闲山岛前海，布置鹤翼阵先以各种火铳的强大火力击沉了2、3艘，敌军溃败而逃。
洒川海战
就在这时朝鲜舰队全力出击，击毁并拿下了层阁船7艘、大船28艘、中船17艘、小船7艘的大战果。指挥这一战斗的胁坂安治乘快速船侥幸逃脱，敌船也只有10余艘逃离。这一场战斗被称之为闲山大捷。这一大捷使朝鲜水军掌握了制海权，并对以后战势发展也有了很大影响。
李舜臣的舰队这天临时停泊在见乃梁，9日重新出发寻找剩下的敌船。10日到第二天凌晨在安骨浦炮击和突袭完全消灭了敌残余部队。
此后12日到达闲山九鬼嘉隆岛让元均剿灭从陆路逃脱的敌军，13日回到了骊水。安骨浦海战中大败的日本水军指挥官是九鬼嘉隆。
三次出兵作战共击沉或拿下了敌船100余艘，斩获敌军250余人，取得了开战以来最大战果，但我军损失也不少。无论怎样，通过闲山岛、安骨浦海战，朝鲜完全掌握了制海权，切断了敌军向西海进军。
第四次出战是在8月24日到9月2日之间，李舜臣的联合舰队向敌军根据地釜山浦到达绝影岛后又击沉了敌船数艘。
闲山海战
接着李舜臣向470余艘倭船并排的釜山浦内港，龟甲船打前阵所有舰队全力出击击沉了敌船。但敌长让兵士下船在陆地反击，终日交战后总共击破敌船100余艘。这一战斗中鹿岛万户郑运殉职，以及6人战死、25人受伤。
以后李舜臣于9月2日回到了骊水，但根据地被龚过的倭军此后开始回避海战向陆军转变。
如上所述，朝鲜水军能够在海战连传捷报，可以说靠的是李舜臣出色的战略战术、以及象龟甲船和板屋船坚固性能的战船、可开展舰炮战术的破坏力极强的大型火炮等。因此李舜臣谱写从不言败的战斗，李舜臣制海权的掌握和义兵起义，为扭转战争初期极为不利战况起到了决定性因素。